Katechetikai Központ
Hatvani István Teológiai Kutatóintézet
Interkulturális Tanulmányok Kutatóintézete
Kelet-Közép Európai Karl Barth Kutatóintézet
Közép-Európai Reformáció és Protestantizmus Történeti Kutatóintézet
Liturgiai Kutatóintézet
Missio et Oikodome – Missziológia és Ökumenika Kutatóintézet
Patmosz – Bibliai Tudományok Kutatóintézete
Sepphoris Bibliai Régészeti és Posztbiblikus Zsidó Irodalmi Kutatóintézet
Szociáletikai Kutatóintézet