• Katechetikai Központ
  • Hatvani István Teológiai Kutatóintézet
  • Interkulturális Tanulmányok Kutatóintézete
  • Kelet-Közép Európai Karl Barth Kutatóintézet
  • Közép-Európai Reformáció és Protestantizmus Történeti Kutatóintézet
  • Liturgiai Kutatóintézet
  • Missio et Oikodome – Missziológia és Ökumenika Kutatóintézet
  • Patmosz – Bibliai Tudományok Kutatóintézete
  • Sepphoris Bibliai Régészeti és Posztbiblikus Zsidó Irodalmi Kutatóintézet
  • Szociáletikai Kutatóintézet